科技平臺
| 科研機構 | 下設重點實驗室 | 級別 |
| 心血管醫學研究所 (國家級博士后科研工作站) |
醫學電生理實驗室 | 教育部重點實驗室 |
| 醫學電生理實驗室 | 四川省重點實驗室 | |
| 四川省醫學重點實驗室 | ||
| 四川省高等學校重點實驗室 | ||
| 膜通道功能、結構與信號轉導同步研究基地 | 四川省科技基礎條件平臺 | |
| 心肌電生理實驗室 | 國家中醫藥管理局科研三級實驗室 | |
| 藥物與功能性食品研究中心 | 天然藥物活性物質與分子藥理實驗室 | 四川省高等學校重點實驗室 |
| 醫學基礎研究中心 | 分子生物學實驗室 | 國家中醫藥管理局科研二級實驗室 |
| 表觀遺傳與腫瘤實驗室 | 四川省醫學重點實驗室 | |
| 醫學分子生物學實驗室 | 四川省高等學校重點實驗室 | |
| 腫瘤表觀遺傳實驗室 | 四川省高等學校重點實驗室 | |
| 轉化醫學中心 | 腫瘤醫學研究所 | 四川省國際科技合作基地 |
| 中西醫結合防治器官纖維化實驗室 | 四川省高等學校重點實驗室 | |
| 護理器械研發實驗室 | 四川省高等學校重點實驗室 | |
| 口頜面修復重建和再生實驗室 | 校級實驗室 | |
| 微血管病與微循環實驗室 | 校級實驗室 | |
| 西南醫科大學循證醫學中心 | 循證醫學教育部網上合作研究中心分中心 | |
| 四川醫事衛生法治研究中心 | 四川省哲學社會科學重點研究基地 | |
| 醫學人文研究中心 | 醫院管理和發展研究中心 | 四川省高等學校人文社會科學重點研究基地 |
| 附屬醫院科研機構 | 分子醫學實驗中心 | 四川省教育廳重點建設實驗室 |
| 分子影像實驗室 | 四川省醫學甲級建設重點實驗室 | |
| 炎癥與變態反應實驗室 | 院級實驗室 | |
| 腫瘤放射生物實驗室 | 院級實驗室 | |
| 川南醫學轉化研究院 | 生物資源庫 | 院級實驗室 |
| 醫藥與健康大數據平臺 | 院級實驗室 | |
| GMP級細胞制備與質控平臺 | 院級實驗室 | |
| 診斷與檢測技術平臺 | 院級實驗室 | |
